叶尔羌汗国的建立者是查加台的后裔赛义德。他是东察合台汗国曼苏尔汗的三弟。为了争夺权力，他联合另一个兄弟赫里列，在伊犁河谷和齐河流域对曼苏尔汗发动暴动，颠覆了伊利巴利政权。很快，暴乱被曼苏尔·汗平息，赫利耶被杀。赛义德逃到帕米尔高原，控制了费尔干河流域。因在塔里木盆地南部扩张屡遭挫折，逃到阿富汗喀布尔市，投奔远亲铁木兰的后裔巴布尔。
1512年，赛义德随巴布尔的军队回到撒马尔罕。然而，在1512年，乌兹别克军队占领了费尔干河流域，巴布尔军队被击败。赛德再次进入塔里木盆地南缘，开始建立叶尔羌汗国。
1512年秋，赛德率部攻占阿图什，切断阿克苏与喀什的联系，围困杜格拉的统治者阿巴拜克。暴君阿巴贝克被困三个月，逃到叶尔羌城。1513年，喀什、阿克苏、叶尔羌先后被赛德军攻占。在叶尔羌城被攻陷之前，阿巴贝克让位给他的儿子，带着大量财宝逃走了。他将大量珍宝倒入卡朗古河，企图拖延赛德军队的追击。然而，他仍然在昆仑山被抓获，并在去叶尔羌的路上被秘密处决。1514年，赛德正式称汗，并建立了叶尔羌汗国。
叶尔羌汗国
1.表示1514-1533
2.丧失美德1533-1559
3.阿卜杜勒·哈莱姆1559-1591
4.马黑马1591-1609
5.阿海马1609-1618
6.沙拉夫丁素丹1614-1615
7日，谭1618突然来到地摊
8.阿布杜·拉蒂夫1618-1630
9.苏丹阿黑麻1630-1632
10.快谭马和睦1632-1635
11.苏丹1635-1638年的黑麻
12.阿卜杜拉哈1638-1667
13，尤其是勒巴尔1667-1670
14.阿卜杜勒·拉蒂夫1670
15、司马懿耶律1670-1680
吐鲁番叶尔羌汗国的统治者
1.马黑马1571-1574
2.马海姆·阿里布·巴布1575-1579
3.阿布纳西尔赫里马1579-？
4.马黑马虎反复回答1583-1594
5.阿卜杜拉希1595-1634
6.阿布·穆罕默德1634-1653
7.Abudullah 1634-1667
8.Babai 1653-1678
9.易卜拉·木易1653-？
叶尔羌汗国被准噶尔汗国消灭后支持的傀儡统治者
1.abdu risht 1678-1681
2.穆罕默德·艾明1681-1692
3.雅雅合照1692？- 1694?
4.穆罕默德·穆明1694-？
5.快谭马和睦1694-？
6.Mirza Alaimu Shabok？
