1复旦大学:1985年，上海第一医学院更名为上海医科大学；2000年4月，复旦大学与上海医科大学合并组建新的复旦大学。

2上海交通大学:1999年9月，上海农学院并入上海交通大学，成立上海交通大学农学院；2001年，上海海洋水下工程科学研究所并入学校；2005年7月，上海第二医科大学与上海交通大学合并成立上海交通大学医学院。

3同济大学:1996年上海城建学院、上海建材工业学院合并为同济大学；2000年4月，学校与上海铁道大学合并组建新的同济大学，重新开办医学院；2003年，上海航空空工业学校划归同济大学管理。

4华东师范大学:1980年7月，上海师范大学恢复华东师范大学校名；1997年8月，上海幼儿师范高等专科学校合并，上海林楠师范学校划归学校管理。1998年9月，上海教育学院与上海第二教育学院合并。

5华东理工大学:1980年8月，上海化工学院恢复华东化工学院原名；1984年华东化工学院并入上海交通大学机电分院；1993年2月，华东化工学院更名为华东理工大学；1996年，上海石油化工学院合并，成立华东理工大学石油化工学院。2000年11月，华东理工大学石油化工学院大幅合并；

6东华大学:1980年，上海纺织工学院恢复华东纺织工程学院校名；1985年更名为中国纺织大学；1994年11月，中国纺织服装协会管理干部学院并入学校；1999年8月，上海纺织学院合并；1999年9月，学校更名为东华大学；同月，国家轻工业局上海玻璃搪瓷研究所合并；2003年5月，东华大学无锡校区并入江南大学。

7上海财经大学:1985年9月，上海财经大学更名为上海财经大学

8上海大学:1978年11月，华东师范大学仪器电子分校、上海科技大学分校、上海外国语大学分校成立；12月，上海机械工程学院轻工分院、复旦大学分院成立；1983年，上海大学成立，由学校本部和五个学院组成。五所学院由原复旦大学分校改为上海大学文学院；原上海机械学院轻工分院改为上海大学工商管理学院；原上海外国语大学分校改为上海大学外国语大学；原华东师范大学仪器电子分校、上海科技大学分校、上海机械工程学院轻工分院的机械电子专业合并为上海大学工程学院；原上海美术学校改为上海大学美术学院。1993年4月，上海法学院并入上海大学。1994年5月，上海工业大学、上海科技大学、上海大学、上海科技学院合并组建新的上海大学。

9上海理工大学:1994年2月，上海机械工程学院更名为华东理工大学；1993年2月，上海机械学院更名为上海机械学院。1996年5月，华东理工大学与上海机械学院合并组建上海理工大学。1999年，上海光学仪器研究所并入学校；2003年7月，上海医疗器械学院、上海出版印刷学院划归上海科技大学管理，部分资源参与上海科技大学医疗器械与食品学院、出版印刷与艺术设计学院的创建。

10 .上海中医药大学:1993年，上海中医学院更名为上海中医药大学；2000年，原上海医学院合并。

11上海师范大学:1978年4月，上海师范大学恢复原建制；1984年10月，正式更名为上海师范大学；1978年，上海师范大学分校成立；1994年10月，上海师范大学和上海技术师范大学合并组建新的上海师范大学。1997年9月，上海师范学院与林楠师范学校黄陵卫生保健师范系合并为上海师范大学；2000年，上海谢晋恒通明星学校并入学校；2001年6月，上海行知艺术师范学校合并，上海市教师培训中心划归学校管理；2003年8月，上海旅游学院划归学校管理。2003年11月，上海教育国际交流中心划归学校管理。

上海外国语大学:1994年，上海外国语大学正式更名为上海外国语大学。

13华东政法大学:2007年3月，华东政法大学更名为华东政法大学。

14上海海事大学:1999年，上海海港学校划归上海海事学院管理；2004年，上海海事大学更名为上海海事大学。

15 .上海海洋大学:1985年，上海水产学院更名为上海水产大学；2008年更名为上海海洋大学。

16上海音乐学院:

上海体育学院:2002年10月，原上海体育学院、上海体育技术学院、上海体育科学学院合并组建新的上海体育学院。

18上海工程大学:1978年10月，上海交通大学机电分院、华东纺织工学院分院成立；1984年，华东化工学院并入上海交通大学机电分院。1985年，上海工程大学在两校合并的基础上正式成立；2003年1月，上海高级技工学校转校，成立上海工程科技大学高等职业技术学院和上海高级技师学院。

19 .上海戏剧学院:2002年6月，原上海师范大学表演艺术学院并入上海戏剧学院，成为戏曲舞蹈分院。上海戏曲学校和上海舞蹈学校成为上海戏剧学院附属的戏曲学校和舞蹈学校。

20上海对外经济贸易大学:2013年1月，上海贸易学院被命名为上海对外经济贸易大学。

21上海电力大学:1985年1月，上海电力学院升格为上海电力学院；2018年更名为上海电力大学。

22 .上海政法大学:1984年11月，上海政法管理干部学院成立；1985年，上海法学院成立，与上海政法管理干部学院合署办公；1992年，上海法学院更名为上海法学院。1993年4月，上海法学院与上海大学文学院法律系合并成立上海大学法学院；2004年9月，撤销设立上海政法管理干部学院和上海大学法学院，在两院的基础上设立上海法学院；2008年，上海司法学校并入上海政法大学。

23 .上海立信会计金融学院:1992年4月，立信会计学院更名为立信会计学院；2003年9月升格为上海立信会计学院。1982年，上海财政金融学校改制为上海银行学校；1987年升格为上海金融学院；1992年4月，更名为上海金融学院；2003年9月升格为上海财经大学。2016年3月，上海立信会计学院与上海财经大学合并组建上海立信会计金融学院。

24上海应用技术大学:1990年10月，上海冶金高等专科学校和上海第二冶金高等专科学校合并为上海冶金高等专科学校；1992年4月，上海轻工业学院更名为上海轻工业学院；1992年4月，上海化工学院更名为上海化工学院。2000年4月，由上海轻工业学院、上海冶金学院、上海化工学院合并而成的集团升格为上海工学院。2006年2月，上海香料研究院、上海日化工业研究院合并入校；2016年3月，上海理工大学更名为上海应用技术大学；同年，上海材料工程学校由上海应用技术大学主办。

25 .上海第二工业大学:1984年7月，上海业余工业大学更名为上海第二工业大学；2000年7月，学校由成人高校系列转型为普通高校系列；2001年11月，学校与上海东湖职业技术学院合并组建新的上海第二工业大学。

26上海电机大学:1987年，上海市第一机电工业局职工大学闵行分校并入上海电机制造学校；1992年，上海电机制造学校更名为上海电气职业技术学院；1998年，上海机电工业工人大学一分校与上海机电工业工人中等职业学校合并；2004年3月，上海机电工业工人学院与上海机电工业学校合并；2004年9月，升格为上海电机大学。

27上海商学院:1983年8月，上海财贸管理干部学院成立，中共上海财贸党校成立。1994年10月，上海财贸管理干部学院与第一商务局职工大学、市粮食局职工大学、市供销社职工大学合并筹建上海商业高等职业技术学校，保留上海财贸管理干部学院建制；1998年3月，上海商业职业技术学院正式成立；2004年9月升格为上海商学院；2016年，上海商业教育培训中心并入上海商学院。

28 .上海公安学院:1983年11月，上海公安学校升格为上海公安学院；1992年4月更名为上海公安学院；2017年6月升格为上海公安学院。

29上海海关学院:1980年5月，以上海海关学校为基础，改建为上海海关学院；1996年4月，上海海关学院更名为上海海关学院。2007年3月升格为上海海关学院。

上海卫生医学院:1999年，上海第二医科大学卫生技术学院成立。在此基础上，上海医学院于2005年9月成立。1981年，上海医疗器械工业学院更名为上海医疗器械学院；1992年更名为上海医疗器械学院；2003年5月，学校划归上海科技大学管理。1983年，上海卫生干部培训学院更名为上海卫生工作者学院；1985年更名为上海职工医学院；2010年转型更名为上海卫生职业技术学院。1989年，上海第二医科大学附属新华卫生学校、瑞金医院护理学校、上海市第九人民医院护理学校合并组建上海第二医科大学附属卫生学校；1995年，学校与上海市崇明县卫生学校联合办学，成立上海第二医科大学附属卫生学校崇明分校；1998年9月，上海市嘉定区卫生学校合并；2005年，上海第二医科大学附属卫生学校改制为上海交通大学医学院附属卫生学校。1998年，上海市第一人民医院护理学院并入上海卫生学校。2001年，上海市杨浦区卫生学校并入上海卫生学校；2003年，上海卫生学校与崇明县卫生学校联合办学，成立上海卫生学校崇明分校。2015年5月22日，由上海医学院、上海医疗器械学院、上海卫生职业技术学院合并成立上海卫生医学院。同时，原上海交通大学医学院附属卫生学校和上海卫生学校合并成立上海卫生医学院附属卫生学校；同年，上海市奉贤区中心医院成为上海卫生医学院附属医院。

海军军医大学:1999年海军医学院并入第二军医大学。2017年6月，第二军医大学更名为解放军海军军医大学，第二军医大学名称保留。

上海科技大学:上海科技大学于2013年9月正式成立。