2009年夏天，他被拥有全部“德国武器”的拜仁招募，打破了当时德甲3500万欧元的转会费纪录。在拜仁的四个赛季里，他赢得了一切，在174场比赛中打进了113球。效率惊人。他带领球队两次进入欧冠决赛，并在2012-13赛季赢得了杯赛冠军。在那四个赛季中，他以双赢的局面赢得了七个冠军，并且不留遗憾地离开了拜仁。后来，他效力于佛罗伦萨、贝西克塔什和沃尔夫斯堡，并在2018年冬天回到母队斯图加特。不幸的是，马里奥·戈麦斯成为了“黑脚”，随斯图加特降级。本赛季，马里奥·戈麦斯上演了最后一曲探戈，整个赛季24场比赛打进7球，在斯图加特的升级中扮演了很多角色，最终带领斯图加特重返德甲，上演了完美的谢幕。