图Vedanta Biosciences正在进行一项名为CONSORTIUM-IO的临床试验，以评估该公司的活体生物制药VE800联合检查点抑制剂nivolumab对某些晚期或转移性癌症患者的安全性、耐受性和临床活性。

吠檀多派

这不容易

Olle断言，如果你问足够多的人关于使用细菌作为癌症治疗的前景，你会“发现一些人和我一样相信它，一些人持怀疑态度。”他补充说，这两个人的想法是有道理的，因为“它还处于早期阶段”，而微生物学是一个新的领域，而癌症是一个无情的对手。

吠檀多和Synlogic追求的是同一个目标，即利用细菌控制免疫系统和抗癌，尽管利用细菌的方式不同:

Synlogic的细菌是经过改造的，而Vedanta的细菌是天然的。Synlogic使用单一细菌，而Vedanta使用多种菌株；Synlogic将细菌直接注射到肿瘤中，而Vedanta则希望其细菌能够在肠道中尽可能长时间地定植。

吠檀多使用经鉴定的细菌混合物来制造药物。科学家们开始用纯细胞系制造这些药物，通过单细胞培养和发酵合成，他们得到了一种成分始终相同的产品，从源头上消除了差异。

Olle解释说，选择Vedanta的免疫治疗药物VE800的成分菌株是为了做一些“我们认为对战胜疾病非常重要”的事情。他强调战胜疾病非常重要。“如果我们建立的选择标准是正确的，那么未来可能会有一种好的药物，”他继续说道。“但如果我们的选择标准不正确，那么我们可能需要全部推翻，重新开始。”

韦丹塔的假设主要基于医学博士肯尼亚本田的发现，他是东京利肯综合医疗中心的团队负责人，也是该公司的科学联合创始人之一。Honda发现肠道内细胞毒性CD8+T细胞的聚集依赖于微生物群。

2019年1月，韦丹塔公司的科学家和他们的同事在《自然》杂志上发表了一篇题为《定义的共栖联合体引发CD8+T细胞和抗癌免疫》的文章，解释了该公司是如何开发VE800的。

VE800是从人粪便中筛选出的11株菌株的混合物，能诱导肠道内干扰素-γ CD8+T细胞的聚集。本文还报道了在肿瘤小鼠模型中，这11株微生物的混合物可以增强免疫检查点抑制剂的功效。

自2019年12月以来，韦丹塔的试验招募了54名患者，包括一些对其他药物没有反应的癌症患者。这些患者每天服用韦丹塔的VE800，然后使用百时美施贵宝的检查点抑制剂nivolumab。

当其他公司都在关注代谢产物时，为什么吠檀多要开发一种含有11种细菌的药物？奥尔打了个比方。Vedanta公司看到，如果试图“把海洋烧干，提取几种代谢物”，就很难捕捉到微生物群变化带来的多效性效应。

“我们用细菌代替代谢物作为药物。当然，有些人不同意我们的决定，”奥莱说，“但我认为他们错了。”

在珀尔塞福涅生物科学公司，研究人员使用Hamilton Microlab STAR平台从粪便样本中纯化微生物基因组DNA。提取DNA后，可以通过全基因组测序来确定细菌的种类。

珀耳塞福涅

英雄之战

珀尔塞福涅生物科学公司的首席执行官斯蒂芬妮·卡勒博士可能是奥勒的怀疑者之一。珀尔塞福涅的目标和韦丹塔一样，是利用微生物组增强患者对免疫疗法的反应。

然而，该公司的方法是恢复无反应患者通常缺乏的细菌功能或代谢途径。为了确定恢复的方式，珀尔塞福涅公司进行了一项名为ARGONAUT的研究，这是美国历史上最大的绘制癌症肠道微生物群-免疫轴的研究。

这项研究于五个月前开始，将招募4000名不同种族的晚期癌症患者和1000名健康对照者，并将研究四种类型的实体癌。

这项多年纵向研究的目标是建立一个大规模的真实世界数据库，用于确定微生物组和免疫疗法之间的联系机制。通过将这些不同的微生物群数据输入到机器学习模型中，Culler希望这些模型能够将信息提炼为一个小的解决方案，从而开发出适合不同患者和各种癌症的治疗方法。

早期数据显示，无反应患者的微生物损害与治疗方法和适应症无特异性关系。这些数据鼓励Culler认为一种治疗方法可能适合不同的适应症或人群。她希望在2023年初，珀尔塞福涅能够研发出“微生物组的Keytruda”，这是一种基于微生物组的治疗方法，其中含有一些工程微生物，可以让很多癌症患者受益。

ARGONAUT研究，利用患者的粪便描述其肠道菌群；用病人的血液来描述他们的免疫系统。卡勒说，珀尔塞福涅不仅试图了解患者微生物群中有哪些细菌，还试图了解它们在做什么。

除了对粪便样本进行测序，珀尔塞福涅还收集了微生物代谢物的信息，以揭示它们的功能。库伦指出，这是一套多组分析，会产生关于机制的信息。

库伦在2017年夏天创立珀尔塞福涅时受到了质疑。但在过去的两年里，人们逐渐对她变得乐观起来。她将此归因于不断增长的学术研究和制药公司的支持，这些公司正在投资和/或与微生物公司合作。她宣称趋势正在改变。

这个实验的名字叫做ARGONAUT，Culler和她的同事选择这个名字是为了纪念Jason和ARGONAUT的成就。就像杰森对金羊毛的追求一样，对癌症的微生物增强免疫疗法的探索也有它的英雄。

以珀尔塞福涅的团队为例，ARGONAUT研究的英雄包括每一位试验参与者——每一位患者、临床医生、护士、患者代表和科学家。

作者| |朱丽安娜·雷米尔

编译|赵婧

修订| 617

编辑|笑声

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